Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms