Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Rpl19-ps11-201ENSMUST00000122422 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm18129-201ENSMUST00000208834 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NhsB1AV60 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 AC165159.1-201ENSMUST00000223825 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm37118-201ENSMUST00000194328 406 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 AC068459.1-201ENSMUST00000222492 905 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NhsB1AV60 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms