Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm2A2A7B5 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prdm2A2A7B5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms