Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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