Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms