Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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