Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf17Q99MV7 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf17Q99MV7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf17Q99MV7 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm16350-201ENSMUST00000162958 446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rnf17Q99MV7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf17Q99MV7 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf17Q99MV7 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rnf17Q99MV7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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