Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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