Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms