Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usp27Q8CEG8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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