Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccser1Q8C0C4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms