Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NischQ80TM9 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20907-201ENSMUST00000185201 693 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20919-201ENSMUST00000185282 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21785-201ENSMUST00000185440 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21808-201ENSMUST00000185495 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20898-201ENSMUST00000185598 693 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20800-201ENSMUST00000185634 693 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20902-201ENSMUST00000185643 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21268-201ENSMUST00000185646 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21257-201ENSMUST00000185655 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21733-201ENSMUST00000185670 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm29075-201ENSMUST00000185717 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20889-201ENSMUST00000185749 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm28273-201ENSMUST00000185811 695 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20799-201ENSMUST00000185833 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21160-201ENSMUST00000185838 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21741-201ENSMUST00000185883 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21922-201ENSMUST00000185911 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21275-201ENSMUST00000185958 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20847-201ENSMUST00000186066 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20927-201ENSMUST00000186168 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21810-201ENSMUST00000186188 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21683-201ENSMUST00000186201 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20805-201ENSMUST00000186299 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm28436-201ENSMUST00000186307 698 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm28480-201ENSMUST00000186383 453 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm21912-201ENSMUST00000186393 696 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NischQ80TM9 Gm20881-201ENSMUST00000186397 693 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms