Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnf1Q7TSH7 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ano4-204ENSMUST00000182341 3959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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