Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp49Q6P9L4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp49Q6P9L4 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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