Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms