Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed1Q3V009 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms