Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grin2bQ01097 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Grin2bQ01097 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms