Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VdrP48281 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VdrP48281 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VdrP48281 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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