Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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