Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Prpf38a-201ENSMUST00000079213 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 6330415B21Rik-201ENSMUST00000204215 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd1P40201 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Lgals8-206ENSMUST00000135166 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Tox-201ENSMUST00000039987 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Magea8-201ENSMUST00000070141 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Chd1P40201 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm42538-202ENSMUST00000199431 358 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Chd1P40201 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Chd1P40201 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm33858-201ENSMUST00000216918 1411 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Cd209b-203ENSMUST00000171635 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Ly6c1-205ENSMUST00000187347 522 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm8992-201ENSMUST00000204463 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chd1P40201 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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