Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc11P31313 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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