Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BrafP28028 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BrafP28028 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms