Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PdgfrbP05622 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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