Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usf3B2RUQ2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms