Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Zbed5B2RPU8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Zbed5B2RPU8 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zbed5B2RPU8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zbed5B2RPU8 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Zbed5B2RPU8 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zbed5B2RPU8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Zbed5B2RPU8 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Zbed5B2RPU8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zbed5B2RPU8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zbed5B2RPU8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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