Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Atp8b5A3FIN4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Atp8b5A3FIN4 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp8b5A3FIN4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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