Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac5Q9Z2V6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac5Q9Z2V6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms