Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gpc1Q9QZF2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gpc1Q9QZF2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gpc1Q9QZF2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gpc1Q9QZF2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gpc1Q9QZF2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gpc1Q9QZF2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms