Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rabgef1Q9JM13 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms