Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim39Q9ESN2 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim39Q9ESN2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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