Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms