Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Derl3Q9D8K3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms