Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg3Q9CPX6 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms