Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1b4Q99ME6 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1b4Q99ME6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms