Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms