Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
BsndQ8VIM4 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BsndQ8VIM4 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms