Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc12Q8K2L8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc12Q8K2L8 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms