Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc28bQ8CEG5 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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