Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms