Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp40Q8BWR4 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp40Q8BWR4 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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