Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Htatsf1Q8BGC0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms