Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sft2d1Q5SSN7 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms