Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms