Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp19Q3UJD6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp19Q3UJD6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms