Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Samd11Q1RNF8 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Samd11Q1RNF8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Samd11Q1RNF8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Samd11Q1RNF8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Samd11Q1RNF8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Samd11Q1RNF8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Samd11Q1RNF8 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Samd11Q1RNF8 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samd11Q1RNF8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms