Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ttc39dQ0VF76 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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Ttc39dQ0VF76 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ttc39dQ0VF76 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms