Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms