Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Otx2P80206 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms