Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Kif1b-202ENSMUST00000055647 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms