Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf5P56477 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Irf5P56477 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Irf5P56477 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms